当蛋白与生物素结合时，形成的是生物素-蛋白复合物。这一过程主要通过两种方式实现：
天然存在的生物素化蛋白：如生物素羧基载体蛋白（BCCP），是乙酰辅酶A羧化酶的重要组成部分
人工构建的生物素标记系统：通过生物素连接酶（如BirA酶）将生物素共价连接到特定蛋白的特定氨基酸残基上
然而，在生物技术和医学应用中，最重要的蛋白-生物素相互作用是生物素与亲和素/链霉亲和素之间的高亲和力结合，形成了生物素-亲和素复合物。
生物素与亲和素/链霉亲和素的结合常数Ka高达10^15 M^-1，是自然界中最强的非共价相互作用之一，比大多数抗原-抗体反应的亲和力高出100万至1000万倍。
生物素与亲和素的结合具有高度特异性，几乎不受其他生物分子的干扰。
形成的复合物能够耐受极端pH、温度、有机溶剂和变性剂，保持稳定。
