在生物化学、分子生物学乃至营养学领域,“生物素”是一个高频词。当您在搜索“26个生物素结构符号”时,您很可能正在实验室里奋战、撰写论文,或是在阅读一篇充满专业术语的文献。这个看似专业的搜索请求背后,隐藏着您希望快速识别、理解并应用这些符号的迫切需求。
本文将系统性地梳理和解读所有与生物素结构相关的符号与表示方法,助您彻底攻克这个知识点。
首先,我们必须确认生物素最根本、唯一的身份标识。这通常不会达到26种之多,但它们是所有衍生符号的基础。
小结:当您看到以上任何一个标识,都可以确信其指向的就是您要找的“生物素”分子本身。
这是“结构符号”中最直观的部分,用于展示原子的连接方式和空间构型。
分子结构图:
3D球棍模型:展示了原子的相对大小(球)和化学键(棍),能清晰反映分子的三维立体结构。生物素的一个关键特征是戊酸侧链的灵活性与双环系统的刚性。
空间填充模型:更真实地表示分子中原子电子云的体积和形状,体现了分子的“占据空间”。
小结:结构图用于理解生物素的化学反应性、手性以及如何与蛋白质(如亲和素)结合。
在生物技术领域,生物素因其与亲和素/链霉亲和素的高亲和力结合而成为不可或缺的工具。因此诞生了一系列衍生符号和表示法。
生物素化符号:表示生物素被连接到另一个分子(如抗体、DNA、蛋白质)上。常用“Biotin-”或“Bio-”作为前缀。
Biotin-IgG
表示生物素标记的免疫球蛋白G。5‘-Bio-ACGTA-3’
表示一条5‘末端被生物素标记的DNA链。示意图图标:在技术手册、实验流程图中,常用一些简单的图形来代表生物素,以提高绘图效率。
[B]
小结:这些符号是阅读生物实验方案、产品说明书和科学图表时必须掌握的“视觉语言”。
不同试剂公司会为他们生产的生物素及其衍生物产品赋予特定的编号,这构成了那“26个符号”中的一大部分。
生物素衍生物编号:生物素上的羧基可以被活化或修饰,生成一系列用于不同标记方法的试剂。
N-羟基琥珀酰亚胺-生物素
,最常用的活化酯,用于标记蛋白质的伯胺(-NH2)基团。磺基-N-羟基琥珀酰亚胺-生物素
,水溶性更好的NHS-Biotin变体。[N-(6-(生物素酰胺)己基)-3'-(2'-吡啶二硫)丙酰胺]
,用于特异性标记巯基(-SH)的可断裂生物素化试剂。去硫生物素
,与亲和素结合力较弱的类似物,可用于温和的洗脱条件。
公司目录号(Catalog Number):例如,Sigma-Aldrich的B4501
、Thermo Fisher的29139
、Cayman Chemical的10016
等。这些数字本身没有化学含义,但唯一对应着一种特定规格和形式的生物素产品。
小结:在订购试剂时,精确的产品目录号(Catalog #) 是避免出错的关键。
为了便于在化学数据库和生物信息学软件中存储和检索,生物素有一套计算机可读的标识符。
C1CC2C(C1) C(=O)NC2SSCCCCC(=O)O
,这是一种用ASCII字符串精确描述分子结构的语言。InChI=1S/C10H16N2O3S/c13-8(14)4-2-1-3-7-9-6(5-16-7)11-10(15)12-9/h6-7,9H,1-5H2,(H2,11,12,13,14,15)
,这是一个分层的、非专有的标准标识符。小结:这些编码是进行计算机辅助药物设计、分子对接和生物信息学分析的基础。
面对如此多的“结构符号”,您该如何选择使用?