细胞裂解液中含有生物素是分子生物学实验中常见的情况,这可能来自细胞自身的生物素化蛋白或实验中添加的生物素标记物。无论是哪种情况,都会对基于生物素-链霉亲和素系统的实验带来显著干扰。本文将全面分析这一问题及其解决方案。
生物素的内源性来源:
外源性生物素来源:
对实验系统的干扰:
生物素-链霉亲和素系统因其极高的亲和力(Kd≈10^-15 M)而被广泛应用于Western blot、免疫沉淀、免疫组化等实验。但当细胞裂解液中存在游离生物素或生物素化蛋白时,会竞争性结合链霉亲和素,导致:
如果您怀疑细胞裂解液中存在生物素干扰,可通过以下方法确认:
点印迹法(Dot Blot):
竞争性ELISA检测:
使用商品化的生物素检测试剂盒,可定量测定裂解液中生物素浓度
阴性对照实验:
在Western blot实验中设置不加一抗的对照,若仍出现信号,表明存在内源性生物素或链霉亲和素非特异性结合
选择替代系统:
考虑使用不与生物素竞争的其他高亲和力系统,如:
使用单体亲和素:
单体亲和素(如NeutrAvidin、CaptAvidin)对生物素的亲和力较低,可减少非特异性结合,同时在酸性条件下可释放结合的生物素,便于膜再生。
培养基优化:
在实验前使用无生物素的培养基培养细胞,降低细胞内生物素水平。
预处理裂解液:
改进实验流程:
热变性处理:
95-100°C加热样品5-10分钟可使许多内源性生物素化蛋白变性并沉淀,通过离心去除,但可能不适用于所有实验。
设置严谨对照:
使用不同检测方法验证:
用非生物素依赖的方法验证结果,如直接偶联HRP的二抗或荧光标记二抗。
在某些情况下,内源性生物素可被利用作为内参:
内源性生物素化蛋白作为内参:
某些分子量明确的生物素化蛋白(如哺乳动物细胞中的120 kDa和75 kDa蛋白)可作为Western blot的内参,但需先验证其在特定细胞系中的表达稳定性。
注意事项:
使用内源性生物素化蛋白作为内参时,需确保实验处理不会影响这些蛋白的表达水平,且其信号强度在线性检测范围内。
细胞裂解液中存在生物素确实会给基于生物素-亲和素系统的实验带来挑战,但通过了解其来源、实施适当的检测方法并采取有效的预防和解决措施,完全可以克服这些困难。关键是根据具体实验需求选择合适的策略,并始终设置严谨的对照以确保结果的可靠性。